Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms