Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cln8Q9QUK3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cln8Q9QUK3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cln8Q9QUK3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cln8Q9QUK3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cln8Q9QUK3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cln8Q9QUK3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cln8Q9QUK3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cln8Q9QUK3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms