Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms