Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Tlr5Q9JLF7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms