Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms