Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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