Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms