Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES46

Parvb, Beta-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvbQ9ES46 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ParvbQ9ES46 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ParvbQ9ES46 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ParvbQ9ES46 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ParvbQ9ES46 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ParvbQ9ES46 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ParvbQ9ES46 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ParvbQ9ES46 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ParvbQ9ES46 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ParvbQ9ES46 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ParvbQ9ES46 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ParvbQ9ES46 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ParvbQ9ES46 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ParvbQ9ES46 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ParvbQ9ES46 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ParvbQ9ES46 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ParvbQ9ES46 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ParvbQ9ES46 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ParvbQ9ES46 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ParvbQ9ES46 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ParvbQ9ES46 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ParvbQ9ES46 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ParvbQ9ES46 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ParvbQ9ES46 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ParvbQ9ES46 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms