Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr61Q9ERF3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms