Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tlnrd1Q9ERE8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tlnrd1Q9ERE8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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