Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms