Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
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