Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms