Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms