Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1dQ9DC28 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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