Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms