Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmbim4Q9DA39 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms