Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9D9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9D9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9D9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9D9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9D9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9D9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9D9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9D9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9D9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9D9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9D9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9D9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms