Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifrd2Q9D8U0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms