Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Cldn22Q9D7U6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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