Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7N2

Krtap26-1, Keratin-associated protein 26-1, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap26-1Q9D7N2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap26-1Q9D7N2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms