Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms