Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb4aQ9D6F9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb4aQ9D6F9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4aQ9D6F9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms