Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
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Rab11fip1Q9D620 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Rab11fip1Q9D620 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Rab11fip1Q9D620 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Rab11fip1Q9D620 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
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Rab11fip1Q9D620 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Rab11fip1Q9D620 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Rab11fip1Q9D620 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Rab11fip1Q9D620 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Rab11fip1Q9D620 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Rab11fip1Q9D620 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Rab11fip1Q9D620 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Rab11fip1Q9D620 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Rab11fip1Q9D620 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Rab11fip1Q9D620 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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