Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.05■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930513O06RikQ9D549 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms