Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl3Q9D4V7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms