Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms