Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms