Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim42Q9D2H5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim42Q9D2H5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim42Q9D2H5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim42Q9D2H5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim42Q9D2H5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim42Q9D2H5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim42Q9D2H5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim42Q9D2H5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim42Q9D2H5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim42Q9D2H5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim42Q9D2H5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim42Q9D2H5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim42Q9D2H5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms