Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms