Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mdm1Q9D067 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms