Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acsl3Q9CZW4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms