Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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