Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MINDY3Q9CV28 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MINDY3Q9CV28 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MINDY3Q9CV28 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MINDY3Q9CV28 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MINDY3Q9CV28 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MINDY3Q9CV28 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MINDY3Q9CV28 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MINDY3Q9CV28 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MINDY3Q9CV28 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MINDY3Q9CV28 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MINDY3Q9CV28 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MINDY3Q9CV28 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MINDY3Q9CV28 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MINDY3Q9CV28 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MINDY3Q9CV28 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MINDY3Q9CV28 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MINDY3Q9CV28 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MINDY3Q9CV28 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MINDY3Q9CV28 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MINDY3Q9CV28 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MINDY3Q9CV28 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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