Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms