Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms