Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms