Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQC3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQC3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQC3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQC3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQC3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms