Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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