Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Ubxn6Q99PL6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms