Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms