Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms