Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlgn1Q99K10 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms