Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Smim11aQ99J19 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Smim11aQ99J19 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Smim11aQ99J19 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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