Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms