Protein–RNA interactions for Protein: Q925H1

Trps1, Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1Q925H1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Trps1Q925H1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trps1Q925H1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms