Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Csmd1Q923L3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Csmd1Q923L3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csmd1Q923L3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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