Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms