Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1bQ91YK2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms