Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd3Q91WC0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms